截至2011年，中国存活艾滋病病毒感染者和病人约为78万人，传染性肺结核患病率降至66/10万
白皮书指出，中国政府坚持“预防为主，防治结合”方针，通过开展预防接种和爱国卫生运动等防控措施，降低了传染病发病率，有效控制了传染病的流行和蔓延。目前，多数疫苗可预防传染病的发病已降至历史最低水平。
白皮书介绍，免疫规划工作是中国卫生事业成效最为显著、影响最为广泛的工作之一。20世纪60年代初，中国通过接种牛痘消灭了天花，较世界卫生组织1980年宣布全球根除天花早了十几年。2000年，中国实现了无脊髓灰质炎目标。2007年，国家决定实施扩大国家免疫规划，国家免疫规划疫苗增加到14种，预防15种传染病，免疫规划人群也从儿童扩展到成人。
重点传染病地方病在中国得到有效控制。艾滋病、结核病、血吸虫病、包虫病、麻风病、疟疾等重大及重点传染病患者获得免费药物治疗。截至2011年，中国存活艾滋病病毒感染者和病人约为78万人，远低于将艾滋病病毒感染人数控制在150万以内的目标。传染性肺结核患病率降至66/10万，提前实现了联合国千年发展目标确定的结核病控制指标。
白皮书指出，中国卫生应急水平全面提高。近年来，中国有效处置了传染性非典型肺炎、甲型H1N1流感、鼠疫、人禽流感等突发公共卫生事件，及时开展四川汶川特大地震、青海玉树地震、甘肃舟曲特大山洪泥石流灾害的紧急医学救援。
