埃及政府食品安全监管体系有三个主要内容：食品安全法律法规；食品安全检查员制度和食品实验室提供技术支持。埃及食品监管功能由多个政府部门共同参与执行，这些部门主要是卫生与人口部，其次是农业农垦部、工业和贸易部。  卫生与人口部的主要职能是负责与农业农垦部和贸工部共同起草有关食品安全方面的法律法规。卫生与人口部下属的食品安全与控制局于2002年起草了一部比较完整的食品安全法。食品安全与控制局通过以下单位，参与全国各级的食品安全监管活动：一是食品安全最高委员会。该委员会隶属于卫生与人口部，另外还有各级研究机构和大学院校的专业人士参加。这个机构在食品安全问题上有最高的发言权。第二是拒绝食品进口委员会，负责处理进口食品中的问题。  全埃及约有500名食品安全检查员，他们属于卫生与人口部管理，主要活动是检查食品安全设施情况、管理情况和从各地区收集食品样品提交给卫生部实验室，供其化验分析，以决定对违规者采取法律行动。在全国的每个卫生所都有一名食品安全检查员，同样，在每个海港和机场也配有食品安全检查员。卫生与人口部下属的营养研究所负责对每种特殊食品的登记注册，其中包括对婴儿食品及其他配方食品、植物饮料、瓶装水等进行化学成分、微生物及生物成分的分析研究。中央公共卫生实验室同样隶属于卫生与人口部，这个实验室的主要功能是采取预防性措施，对包括食品、饮用水、废水进行分析研究，这个实验室每年接受30万份食品样品进行化验。

  农业和农垦部在食品安全监管方面扮演的角色，一是通过它所属的食品及饲料中央实验室对所有进口和本地生产的动物源性食品如肉类、鱼类、奶类和蛋类食品和饲料的质量和安全性的监控，及对动物皮毛及其产品卫生安全状况的监控。二是通过兽医服务局对进口的动物进行检疫检验。兽医服务局还负责跟综研究各国的流行病，凡进口的动物源性食品必须获得埃及兽医服务局的批准。农业和农垦部还负责埃及的生物安全系统。目前，埃及农业和农垦部的实验室正在进行转基因农作物的生产试验。  

  贸工部通过其标准局负责颁布各种食品的生产标准，还通过其下属的进出口总局和卫生与人口部及农业农垦部联合对进出口食品的安全进行统一监控。