2月，全国深化医药卫生体制改革工作会议召开，国务院办公厅对2011年的医改主要工作作出了安排，国务院医改办与各省、自治区、直辖市、新疆生产建设兵团等医改领导小组签订了2011年医改工作责任书，统筹推进医药卫生体制五项重点改革。

3月，卫生部办公厅印发《关于开展基层医疗卫生机构全科医生转岗培训工作的指导意见（试行）》的通知。

3月，卫生部、国务院医改办公室召开2011年公立医院改革试点工作会议,加快推进公立医院改革试点工作。

4月,为使医改成效尽快惠及广大农村居民，卫生部、民政部等下发《关于做好2011年新型农村合作医疗有关工作的通知》。

7月，国务院办公厅发布《关于进一步加强乡村医生队伍建设的指导意见》，进一步夯实农村医疗卫生服务“网底”，保障广大农村居民基本医疗和公共卫生服务的公平性、可及性。

7月，《国务院关于建立全科医生制度的指导意见》印发,对建立全科医生制度作出战略性的安排,要求力争到2012年，每个城市社区卫生服务机构和农村乡镇卫生院都有合格的全科医生。

7月， 国务院办公厅转发发展改革委、财政部、卫生部《关于清理化解基层医疗卫生机构债务意见》,希望通过将基层医疗卫生机构的债务清理打包解决，配合综合改革的推进，促使基层医疗卫生机构回归公益性运行机制。

11月，国务院深化医药卫生体制改革领导小组第十次全体会议召开，会议审议了《〈医药卫生体制改革近期重点实施方案（2009—2011年）〉实施中期评估报告》、《“十二五”期间深化医药卫生体制改革规划（2012—2015）》和《关于县级公立医院改革试点的意见》等文件。