农副食品加工业物流成本是指在农副食品原辅料购进和农副食品产成品销售过程中产生的费用，包括运输、储存、包装、流通加工等活动的费用。物流成本是农副食品成本的重要组成部分，要降低农副食品价格，除了降低农副食品本身的生产成本外，必须降低农副食品的物流成本。

2010年全国重点企业物流统计调查数据显示，2009年我国农副食品加工业物流成本依然偏高，同时物流效率有所下降，与发达国家存在一定的差距。

农副食品加工业物流规模快速增长。根据行业统计和调查企业数据推算，2009年我国农副食品加工业物流总额2.9万亿元，同比增长17%，农副食品加工业货运量10.6亿吨，同比增长27.5%；农副食品加工业物流费用率有所上升。调查企业汇总数据显示，2009年农副食品加工业物流成本费用率为12.9%，同比提高0.2个百分点。按此物流费用率推算，2009年我国农副食品加工业物流成本大约3563.6亿元，比2008年增长55.2亿元。

运输环节物流成本占一半以上。管理成本占14%，同比上升1.8个百分点，仓储成本占12.7%，同比提高2.6个百分点，包装成本占2.1%，同比提高0.5个百分点，配送成本占8.2%，同比提高3个百分点，流通加工成本占0.6%，同比提高0.5个百分点。

农副食品加工业物流效率与发达国家差距拉大。2009年日本农副食品加工业物流费用率为9.12%，比我国低3.78个百分点，我国农副食品加工业物流效率与日本差距有所扩大。中国农副食品加工业物流如果达到日本同业的水平，2009年我国农副食品加工业物流可节约近30%的物流成本。