湿地具有巨大的生态功能和其他生态系统不可替代的作用。北京市制定了湿地保护总体目标，到2010年95％的湿地建立湿地自然保护区。湿地保护区达到12个（其中国家级3个，市级4个），使7个重要湿地自然保护区保护和管理能力显著加强。

  北京市重要湿地保护示范建设分为6大工程：一是退牧还泽、还草工程。该工程规划还草1500公顷，封沙育草1000公顷。还草工程综合成本每公顷1万元；育草工程综合成本0.1万元，资金投入1600万元。二是退耕还泽、还滩工程。该工程开展退田还泽1000公顷，还滩1000公顷。综合成本每公顷1.5万元，资金投入3000万元。三是湿地生物多样性保护及栖息地恢复工程。该工程开展湿地生物多样性栖息地恢复示范面积1000公顷，综合成本每公顷1.5万元；重建或恢复湿地野生动植物栖息地2.7万公顷，综合成本每公顷0.3万元，资金总投入9600万元。四是重点湿地保护区移民工程，资金投入750万元。五是生物治理“绿肾”工程试验示范。规划试点500公顷，综合成本每公顷2万元，资金投入1000万元。六是退化湿地恢复前期论证研究工程，投资100万元。