近日，《当代生物学》发表了首次针对中国地区古人类的全基因组研究成果。该项目由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所和德国马普进化人类研究所等团队合作完成，研究分析了距今4万年前出土于北京房山田园洞的一具男性个体基因组，发现东亚早期人群组成十分复杂。
虽然欧洲和西伯利亚地区都有古人类样本基因组被测序，但在东亚，尤其是中国地区被测序的古人类基因组样本非常少。这项研究获取了首个中国地区古人的全基因组数据，也是整个东亚目前最为古老的人类基因组数据。
始于2013年的研究发现，与现代欧洲人相比，田园洞人与现代亚洲人的遗传关系更近，应该是古东亚人群的代表。但2014年新的研究显示，现代欧洲人混入了更为古老的遗传成分，这会导致现代欧洲人在遗传上远离其他人群，无法确定之前的证据是否依然支持田园洞人是古东亚人。
现在，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室通过最新古DNA技术，将仅有0.03%的古人类全基因组数据从富含细菌和真菌DNA污染的古人类DNA样品中捕获出来并测序。通过比较田园洞人和未混入古老遗传成分的欧洲人的基因组数据，确定了4万年前的田园洞人确已呈现亚洲人遗传特征。虽然田园洞人是古东亚人，但他并不是现代东亚人的直接祖先，这暗示了4万年前亚洲人群的多样性。
论文还披露了一些出乎意料的发现。分析显示，4万年前的田园洞人和一个来自比利时3.5万年前的古欧洲人有着遗传上的联系。这种联系在同时期的其他古欧洲人中并没有被发现。因此，很有可能当时的东亚人并非和欧洲人发生基因交流，而是与同田园洞人和比利时古人相关的一个未知人群发生过基因交流。这两个古人个体之间的遗传联系，为欧洲人和亚洲人具有复杂的遗传历史提供了有力的直接证据。
众所周知，美洲现代人的迁移发生在距今约2万年前，由亚洲经白令海峡进入美洲。田园洞人生活在4万年前，研究者预期，所有的美洲土著人群应该和田园洞人有着相同的遗传联系。而让人意外的是，在美洲土著人群中，亚马逊人与田园洞人的关系最近。这一结果显示，美洲土著人群也具有遗传多样性，是由至少两种甚至更多不同的亚洲祖先人群繁衍而来，而其中至少一种与4万年前的田园洞人有着联系，这也反过来给东亚史前人群多样性研究提供了线索。
