“发展民族药、中药或天然药物，创新是主题。充分应用现代科技理论与方法，对民族药知识和经验进行科学分析及评价，其意义在于开发出更好的新药，以满足人类的健康需求，同时有效推动资源转化，带动民族地区发展。”

朱兆云坚守在民族药工程科技领域一线，提出基础研究与应用开发结合的民族药研究模式，带领团队实施了资源调查研究系统工程，主编出版相关专著5部20卷1078万字，建立3个共享信息数据库；基于调查发掘源头，以民族民间传统用药经验为线索进行多学科药物筛选和评价研究，发明创制彝族药新药5个，取得6个已实施的国家发明专利；建立起民族药研发体系及技术平台，探索出一条切实可行的“资源调研—规范化研究—成果产业化”的民族药创新发展路径。荣获2012年度国家科学技术进步一等奖、云南省科学技术进步特等奖。2014年被授予个人中医药学术发展特别贡献奖。为2015年度云南省杰出贡献奖候选人。