当前，畜禽种质资源有两个现象值得关注。其一，英国樱桃谷公司培育的北京鸭配套系在我国的年出栏量超过24亿只，而原产我国的北京鸭因料肉比高、胸腿肉率低，市场占有率迅速萎缩，英国樱桃谷北京鸭已成为我国烤鸭、板鸭、盐水鸭等产品的首选鸭源。其二，过去的十多年里，由于洋种猪的生猪生长速度快、饲料转化率高等优势，我国不少地方纷纷改养杜洛克、大约克等瘦肉型洋种猪，导致一些地方特色品种猪饲养量逐步下降、布点场也不断缩小。

由于本土物种资源保护意识的相对落后，多年来我国一直是畜禽物种资源的提供国，类似北京鸭这样被发达国家拿走“混血”改良后再重新抢占中国市场的案例并不少见。虽然说英国北京鸭和瘦肉型洋种猪的优势地位是市场的自由选择，契合了养殖主体的经济需求，从畜禽品种交流和增加养殖效益的角度看也无可非议。不过，这一市场空间的丢失正提醒我们必须保护好、利用好本土畜禽种质资源。

我国畜禽资源丰富，经过长期自然选择而现存的大量地方品种犹如一座基因宝库。即使是有些在当前看来被认为是生产性能不高的品种，其蕴藏的科学价值和经济价值也是巨大的。如，我国地方猪种虽然屠宰率偏低、瘦肉率少，但繁殖力和抗逆性强、肉质较好；本地的北京鸭品种虽胸腿肉率低但皮脂率高，是加工北京烤鸭的优质原料。

北京鸭和洋种猪的问题，背后是我国本土畜禽种质资源如何保护和开发的问题。而本土畜禽种质资源的保护和开发从本质上来讲则是市场和科技的问题，这离不开科研单位和龙头企业的联姻。今后，本土畜禽种质资源保护和开发双向机制的建立，就需要科研单位创新先期开发与企业市场推广相结合。

畜禽品种的选育研究常常需要十几年或更长的时间，从科研角度看，不能是什么畜禽品种有经济效益就追着研究什么，而要“十年磨一剑”，需要系统的科学研究规划以及基础的科技和资金投入做后盾。有关专家表示，如果不抓紧积极保护和合理开发，可能会像某些国家那样，由于连续定向选择，使得品种间的遗传变异越来越窄，最终导致可用种质资源的减少。

对企业来讲，则要根据市场需求，大力推进畜禽地方品种的商业化利用，实行产业化开发，通过独特的品种培育和创新畜产品加工的方式方法，生产出优质产品。本土品种关联的畜禽产品在市场中打出品牌和竞争力，也可为畜禽品种的保护奠定现实基础。

本土畜禽资源保护和利用面临着有利机遇。在法律支持方面，畜牧法在《畜禽遗传资源保护》一章中在“原产我国的珍贵、稀有、濒危的畜禽资源实行重点保护”方面进行了一系列规定，这是我国在保卫畜禽物种主权方面的重大决策。在市场需求方面，随着生活水平的不断提高，消费者对畜产品的风味和口感追求越来越高，地方畜禽良种的开发恰恰适应了畜产品市场多样化和特色化的要求。在这些发展机遇下，本土畜禽种质资源将会得到最大化保护和利用。