在空间天气研究领域，自“七五”以来，我国有关部门相继组织了有关认识日地系统基本物理过程的重大项目，取得了丰硕成果。大规模的空间天气研究开始于上世纪90年代中后期，国家自然科学基金持续设置有关重大项目，支持空间天气研究。1999年，国家科技部等10个部委提出“国家空间天气战略规划建议”。

在载人航天和“863”计划的系统支持下，中国科学院空间环境预报中心于1992年开始筹建，1999年投入运行。此外，中国科学院国家天文台是我国开展太阳活动空间天气预报的主要单位，信息产业部电波传播研究所是我国开展电离层空间天气预报的主要单位，北京大学还成立了空间天气分析中心。

中国航天局与欧洲航天局合作开发的双星计划的第一颗星于2003年12月发射升空,第二颗星于2004年7月成功发射。