4月14日17时20分，兰州军区兰州总医院接到增援玉树灾区的命令，迅速组成应急医疗救援队。医院政委朱自清带领103名医疗队员赶往灾区。

  为争取时间，朱自清让地震灾区急需的医疗队员坐飞机，自己带领50名保障人员，满载医疗器材、帐篷和给养，一路颠簸前往玉树。在平均海拔4000多米的高原上翻冰山，疾驰16个小时，于16日凌晨2点半到达灾区。他顾不上休息，带领医疗队员连夜搭建帐篷，开设野战医院，收治伤员。

  一名被掩埋了44小时的孕妇被送到医疗队，因受伤出现早产症状，需立即进行剖腹产手术。有人提议：“手术风险太大，还是转到其他医院吧。”朱自清说：“我们是人民军医，怎能推脱责任，有问题我负责，赶快手术！”孕妇很快被送进了手术车，顺利产下一名女婴，母女平安。随后，他还托人从兰州买来婴儿用的包被、奶粉、衣服、湿巾等。

  巡诊中，朱自清发现孤儿旦吉文毛患有重度口腔溃疡，可能危及生命。他把且吉文毛抱回医疗队，叮嘱儿科医生戴永利尽快治愈。看到两位藏族老人在帐篷里生活困难，朱自清和医疗队员徐越斌把身上的1000多元钱全部留给了老人。

  4月18日上午，正当朱自清带领医疗队员抢救受伤群众时，他突然接到弟弟的电话：“父亲去世，临终前还一直叫着你的名字。”挂断电话，朱自清泪水涌出眼眶。为了不影响队员们的工作情绪，他悄悄擦干泪水。同事李晓明知道朱自清父亲长期卧病在床，此时早已猜出了几分，朱自清恳请他不要向领导汇报：“不能跟任何队员说，这是一条纪律。”

  当晚，丧父之痛加上超强度的工作和强烈的高原反应，让朱自清体力严重透支，高烧40.2℃，血压急速升高。医务人员将他按在床上，挂上了吊瓶。清晨，他偷偷拔掉针头，又回到指挥岗位。

  救援期间，在他的带领下，兰州军区总医院医疗队共接诊伤病员2688人次，巡诊6115人次。