1979年1月1日，伴随着中国改革开放拉开序幕，南京海关成立。30年来，作为江苏改革开放进程的见证者、参与者，南京海关在海关总署领导下，认真履行职责，坚持科学发展，在改革中发展，在服务中创优，业务和队伍建设成就突出：

  ———各项业务指标位居全国海关前列。2007年，征收入库税款660.6亿元，列全国海关第3位；2008年税收有望突破760亿元，审批各类减免税货值已连续5年列全国海关第1位；加工贸易、统计等多项工作始终保持全国海关的领先地位。监管进出境货物1.5亿吨、货值2182.2亿美元，均列全国海关第3位；审核进出口报关单388.3万份，列全国海关第4位。

  ————改革创新成果丰硕。率先开启了“两水两路”快速通关改革，转关货物通关时间缩短2/3。率先试点并推广区域通关改革，在全关区实现“属地申报、口岸验放”，形成了联通东西、贯穿南北的多通道立体化通关体系。先后产生了全国海关第一本加工贸易联网监管手册，第一本H2000版加工贸易电子账册；推动建立了全国第一个综合保税区、第一个出口加工区、第一个保税物流中心（B型）、惟一内河型保税区和保税物流园区。

  ————服务经济亮点频现。坚持以人为本，以服务江苏开放型经济发展为己任，把人民的根本利益作为海关工作的出发点和落脚点；不断拓展海关政务公开形式，首创“关长专线”服务社会品牌；提供优质通关服务，首开综合业务改革，推行“守法便利”战略，促进进出口贸易便利化；服务区域发展战略，全力支持陇海沿线和苏北振兴，承担了新亚欧大陆桥中国段90％以上的国际过境箱量的查验、放行重任，陆桥运输中国段4131公里所需时间由原来的15天减少为5天。

  ————队伍建设成效显著。南京海关共有全国先进基层党组织1个，全国文明单位2个，全国精神文明建设先进单位2个，全国创建文明行业工作先进单位1个，全国创建文明行业示范点1个，全国公安先进基层建设单位1个，江苏省文明单位12个，国家级青年文明号8个，省级青年文明号25个。涌现出以全国先进工作者、全国杰出青年卫士、五一劳动奖章获得者洪峰同志为代表的一大批模范人物。