2008年9月上旬和下旬，淮河流域水环境监测中心分别对淮河流域跨省河流50个省界断面水质进行了2次监测，同时对淮河干流、大运河35个重点控制断面水质进行了1次监测。监测项目包括水温、pH、溶解氧、高锰酸盐指数、化学需氧量（COD）、五日生化需氧量、氨氮、总磷、铜、锌、氟化物、硒、砷、汞、镉、六价铬、铅、氰化物、挥发酚和阴离子表面活性剂共二十项。

  按照《地表水环境质量标准》（GB3838—2002），采用月平均值对省界断面水质进行评价，9月份淮河流域50个省界断面水质综合评价结果是：水质较好满足Ⅲ类水的断面25个，占50％；水质一般达到Ⅳ类水断面10个，占20％；水质受到污染的Ⅴ类水断面4个，占8％；水质严重污染的劣Ⅴ类水断面11个，占22％。与上个月相比，本月省界断面水质略有下降，满足Ⅲ类水质的比例下降了2个百分点。

  按照水功能区划省界缓冲区水质目标对省界断面水质进行达标评价，9月份省界断面有27个达标，达标率为54％。按照主要污染项目超标倍数评价，本月水质污染较重的跨省河流有：河南进入安徽的涡河、惠济河和大沙河；江苏进入安徽的奎河。本月大沙河河南出境断面砷超标仍然严重，请河南省环保部门高度重视，加强对有关排污企业的监督检查。本月省界断面水质主要超标项目为：COD、总磷、高锰酸盐指数和氨氮。

  按照河南、安徽、江苏、山东省淮河流域水污染防治工作目标责任书确定的2008年水质考核目标，对25个国家考核省界断面进行水质评价。高锰酸盐指数单项达标率为100％；氨氮单项达标率为80％，其中河南省10个出境断面有8个达标，安徽省4个出境断面全部达标，江苏省2个出境断面有1个达标，山东省9个出境断面有7个达标。

  按照水功能区划和《南水北调东线工程治污规划》确定的Ⅲ类水水质目标，对淮河干流和大运河水质进行达标评价。

  淮河干流：监测的13个断面，有12个断面水质达标，占92.3％；超标断面为小柳巷断面，超标项目为COD。

  大运河：监测的22个断面中，有12个断面水质达标，占54.5％；超标断面10个，超标率为45.5％。主要超标项目为化学需氧量。 

  评价结论：9月份淮河流域省界断面水质与上个月相比略有下降。按照水质类别评价，本月满足Ⅲ类水断面的比例比上个月下降了2个百分点；按照水功能区省界缓冲区水质目标评价，水质达标率比上个月下降了4个百分点；按照“目标责任书”确定的2008年水质考核目标评价，25个国家考核省界断面高锰酸盐指数达标率比上月上升了4个百分点，氨氮达标率比上月下降了8个百分点。