从地震发生当晚派出第一支医疗队紧急驰援四川灾区以来，第三军医大学党委按照军委总部首长的指示，已先后派出7支应急医疗队、6支卫生防疫分队、1支装备物资保障分队，327名救援队员，分布在四川汶川县、德阳市、理县、北川县等灾区一线开展救援。

  12日14时28分汶川地震发生时，第三军医大学驻地重庆震感明显。校党委在总后驻渝抗震救灾指导协调小组的领导下，一边组织人员紧急疏散，确保部队安全，一边在第一时间组织应急医疗队驰援四川灾区。

  “灾情就是命令，必须在第一时间赶到灾区，为挽救伤员生命作出最大贡献。”学校党委书记、政治委员高福锁的话掷地有声。

  12日23时，三医大从三所附属医院抽调由骨科、创伤科、手术麻醉科、普通外科专家等组成的联合应急医疗队，携带价值数十万元的急救医疗装具和药品，紧急赶赴四川灾区。

  13日6时20分，医疗队抵达德阳，迅即开展救灾工作，成为军队第一支赶到灾区并开展救治工作的医疗队。

  13日12时，该校第二批3支医疗队共计101人，由校长王登高带队，紧急开赴四川汶川开展救援。

  14日15时，学校紧急派出20人的抗震救灾装备物资保障分队，携带野战手术车、野战防疫车、野战炊事车、运水车等救灾急需装备，赶赴四川灾区。6个小时后，第3批3支抗震救灾医疗队共计117人，紧急开赴四川灾区。

  15日22时30分，又一支由30多名精干力量组成的卫生防疫队向四川北川县进发。

  汶川大地震发生后，三医大教职员工先后有7000人向党委、支部请缨奔赴救灾一线。

  附属西南医院一级教授杨宗城，不顾78岁高龄，请求参加医疗队，他说，“我有几十年的临床经验，能挽救更多群众的生命！”

  经历过唐山大地震的肝胆外科副教授杨占宇向党组织递交了请战书，要求第一时间赶到灾区抢救伤员。  

  王登高校长13日中午亲自率领两支应急医疗队奔赴震中汶川，但由于交通中断，13日晚受阻于都江堰市。14日中午，王登高果断决定，69名医疗队员每人背着重达30多公斤重的急救药品，分3批乘冲锋舟沿岷江逆水行进，冒着随时都可能发生的泥石流和塌方的危险，徒步负重行军10余公里山路，于14日17时10分到达震中汶川县映秀镇，成为最早赶到该镇的抗震救灾医疗队。

  而率第一支军队医疗队赶到四川灾区的赵先柱副校长，已经在德阳一线连续工作了100多个小时；在汶川县城指挥救治工作的张朝宁副政委，15日上午刚为灾区献了血，当日深夜即率队出征。

  为了提高重伤员的治愈率、降低致残率，应当地卫生部门和医院的请求，该校于15日派出救护车辆和人员，赴德阳将62名重伤员转运到附属的西南医院、新桥医院和大坪医院进行集中治疗，连夜实施手术9例。到18日18时，已经成功实施手术34例，所有伤员生命体征平稳。